Les études pharmaco-épidémiologiques permettent de compléter les données des ventes d’antibiotiques en décrivant les pratiques d’utilisation des antibiotiques en conditions d’élevage. Plusieurs enquêtes transversales ont été menées dans les filières de ruminants entre 2006 et 2012 au moyen de questionnaires portant sur les deux derniers traitements antibiotiques : auprès des vétérinaires et éleveurs bovins, des éleveurs ovins et des éleveurs et vétérinaires caprins. Des informations sur le contexte pathologique ayant motivé la prescription ou l’administration, les antibiotiques utilisés, le cadre médical de l’utilisation (interaction avec le vétérinaire, présence d’une ordonnance) et le respect de l’AMM ont été recueillies. Les molécules les plus utilisées dans les différentes filières de ruminants étaient identiques et appartenaient à des familles anciennes (pénicillines, aminosides, tétracyclines). Mais le recours aux céphalosporines de troisième et quatrième générations et aux fluoroquinolones était fréquent en filière bovine et non négligeable en filière caprine. Les utilisations d’antibiotiques hors AMM (pour l’indication d’espèce, de maladie ou pour le schéma thérapeutique) ont aussi été fréquemment évoquées.