Les élevages porcins de type naisseur-engraisseur sont aujourd’hui fréquemment infectés par plusieurs sous-types de virus influenza A porcins (VIP), devenus enzootiques dans la population et responsables d’épisodes infectieux se répétant en élevage sur chaque bande et à âge fixe. Une fois installés, ces virus semblent persister sur l’élevage et les moyens de lutte à la disposition des éleveurs et des vétérinaires sont limités. Un modèle stochastique de métapopulation représentant la co-circulation de deux VIP dans un élevage de type naisseur-engraisseur a été développé afin d’évaluer des mesures de maîtrise relatives à la conduite l’élevage et à la vaccination visant à rompre ces cycles d’infection. Bien que la vaccination des reproducteurs montre un effet bénéfique chez les truies en réduisant la persistance dans cette sous-population, elle ne permet l’extinction du virus sur la totalité de l’élevage (persistance maintenue chez les porcs en croissance). L’externalisation de bandes de porcelets au sevrage, permettant de rompre la répétition quasimécanique du processus infectieux, apparaît comme la mesure la plus efficace.