La surveillance évènementielle des virus influenza A porcins (swIAVs) menée en France depuis le début des années 2000 montrait, jusqu’en 2018, une prédominance des virus de sous-types H1_avN1 et H1_huN2, lesquels comptaient en moyenne pour environ 65 % et 20-25 % des virus identifiés chaque année (Chastagner et al., 2020). En 2019, le nombre de cas de grippe dus à des souches H1_huN2 a diminué, mais le nombre de virus H1_avN2 a augmenté, ce qui a conduit à une légère modification des proportions des divers sous-types viraux.

Mise en evidence d’un nombre élevé de contaminations croisées entre ateliers de volailles et élevages bovins en 2020 dans le Grand-Ouest.

Des virus influenza A porcins (swIAVs) de quatre lignages génétiques sont connus pour circuler de manière enzootique dans les élevages de porcs en Europe. Les swIAVs enzootiques les plus fréquemment rencontrés en France appartiennent aux lignages H1_avN1 et H1_huN2. D’autres virus sont également détectés sporadiquement, notamment de lignage H1_avN2, issus de réassortiments générés à la faveur de co-infections, par des virus porcins enzootiques, ou des virus porcin et humain (Tableau 1, #C et #D), ou introduits depuis un autre pays.